Øgruppen kan anløbes fra nord og syd. I nordhavnen er der en stor plads til skonnerter, som kan ligge i færgelejet, efter den sidste færge er sejlet. Store både kan bestille plads.
Mindre både ligger i Sydhavnen og kan ikke reservere plads. En svingbro adskiller de to havneafsnit, som kun åbnes i nødstilfælde.
Sejlere bør være opmærksom på vinden, da Sydhavnen ikke kan besejles ved en vindstyrke over 10 sekundmeter ved sydvest og vestlige vinde. For Nordhavnens vedkommende er max vind 12 - 14 sekundmeter fra nord og nordøst.
Under renoveringsarbejdet er sikkerheden ekstra vigtig. Søredningsningsbåden Elefanten skal kunne komme ud til enhver tid, så der er stor fokus på, hvordan havnen pakkes.
Men øen er åben og turister er velkommen. Turbåden fra Gudhjem ankommer dagligt som den altid har gjort, og øens gæstgiveri og små butikker står klar til at modtage gæsterne.
Renoveringen foregår i etaper og er først færdigt med udgangen af 2026. Altså er øen påvirket i to sejlsæsonner. Det giver anledning for gæster på Øen til at følge arbejdet, som mest udføres fra vandet med en pram, udstyret med skurvogn, værktøjscontainer, kran og gravemaskine.
Placeringen og koordineringen af prammen er nøje drøftet med både Christiansøfarten og forsvarets skib Sleipner.